Hậu phi

Mặc dù trong sổ sách Tông Nhân phủ của nhà Ái Tân Giác La chỉ ghi nhận 19 người thê thiếp của Thuận Trị Đế, các nguồn khác cho thấy ông có ít nhất 32 hậu cung[189], Trong đó, 12 người trong số họ sinh được con. Cả hai Hoàng hậu của ông, đều là thân tộc của mẹ ông là Hiếu Trang Hoàng thái hậu.

Sau cuộc chinh phạt năm 1644, những phi tần hậu cung thường được gọi bằng phong hiệu và tên gia tộc của họ, thay vì dùng tên[190].

Hoàng hậu

Phi

• Điệu phi Bác Nhĩ Tế Cát Đặc thị (悼妃博爾濟吉特氏, ? - 1658), con gái Hòa Thạc Đạt Nhĩ Hãn Thân vương Mãn Châu Tập Lễ, bà là cháu gái Hiếu Trang Hoàng hậu, chị em họ của Thuận Trị Đế và Phế Hoàng hậu[191][192].
• Trinh phi Đổng Ngạc thị (贞妃董鄂氏, ? - 1661), con gái của Nhất đẳng A đạt ha ha phiên Ba Độ (巴度), em họ của Đổng Ngạc phi. Bà là phi tần duy nhất tuẫn táng khi Thuận Trị Đế qua đời. Về sau, Khang Hi Đế truy phong làm Hoàng khảo Trinh phi (皇考贞妃).
• Khác phi Thạch thị (恪妃石氏, ? - 1666), con gái của Lại bộ Thị lang Thạch Thân (石申).
• Cung Tĩnh phi Bác Nhĩ Tế Cát Đặc thị (恭靖妃博尔济吉特氏), con gái của Đa La Ngạch Nhĩ Đức Ni Quận vương Bác La Đặc (博罗特). Khang Hi Đế tôn phong làm Hoàng khảo Cung Tĩnh phi (皇考恭靖妃).
• Thục Huệ phi Bác Nhĩ Tế Cát Đặc thị (淑惠妃博尔济吉特氏, 1640 - 1713), em gái của Hiếu Huệ Chương Hoàng hậu. Năm 1654 được sách phong làm Phi (không rõ phong hiệu). Khang Hi Đế lên ngôi, tôn làm Hoàng khảo Thục Huệ phi (皇考淑惠妃).
• Đoan Thuận phi Bác Nhĩ Tế Cát Đặc thị (端顺妃博尔济吉特氏), con gái của Nhất đẳng Thai cát Bố Đạt Hi Bố (布达希布). Khang Hi Đế tôn phong Hoàng khảo Đoan Thuận phi (皇考端顺妃).
• Ninh Khác phi Đổng Ngạc thị (宁悫妃董鄂氏), con gái của Trưởng sử Khách Tể Hải (喀济海), sinh Hoàng nhị tử Phúc Toàn. Khang Hi Đế tôn phong Hoàng khảo Ninh Khác phi (皇考宁悫妃).

Thứ phi

• Thứ phi Trần thị (庶妃陈氏, ? - 1690), sinh ra Cung Thân vương Thường Ninh và Hoàng trưởng nữ. Khi Thuận Trị Đế sủng ái Hiếu Hiến Đoan kính hoàng hậu, Thứ phi âm mưu đố kị hãm hại, bị Hiếu Trang Hoàng thái hậu phát hiện và đày vào lãnh cung, Cung Thân vương cũng không được vào thăm. Đến thời Khang Hi Đế thì Thứ phi chết, niệm tình xưa mà Khang Hi Đế truy phong làm Hoàng thái phi.
• Thứ phi Mục Khắc Đồ thị (庶妃穆克图氏)[193], sinh hạ Hoàng bát tử Vĩnh Cán[194].
• Thứ phi Ba thị (庶妃巴氏), sinh Hoàng trưởng tử Ngưu Nữu và Hoàng tam nữ.
• Thứ phi Đường thị (庶妃唐氏), sinh Hoàng lục tử Kì Thụ.
• Thứ phi Nữu thị (庶妃钮氏), sinh Hoàng thất tử Long Hi.
• Thứ phi Dương thị (庶妃杨氏), sinh ra Hòa Thạc Cung Khác Trưởng Công chúa.
• Thứ phi Ngô Tô thị (庶妃乌苏氏), sinh Hoàng tứ nữ.
• Thứ phi Vương thị (庶妃王氏), sinh Hoàng ngũ nữ.
• Thứ phi Nạp Lạt thị (庶妃纳喇氏), sinh Hoàng lục nữ.

Con cái

11/32 phi tần của Thuận Trị sinh cho ông tổng cộng 14 người con,[195] nhưng chỉ có bốn con trai (Hoàng nhị tử Phúc Toàn, Hoàng tam tử Huyền Diệp, Hoàng ngũ tử Thường Ninh và Hoàng thất tử Long Hi) và một con gái (Cung Khác trưởng Công chúa) sống đến tuổi kết hôn. Không như những Hoàng đế Thanh triều về sau, tên các con trai của Thuận Trị không có lệ đặt cùng một tên lót.[196]

Con trai

Con gái

Trước khi triều đình Mãn Thanh đến đóng ở Bắc Kinh năm 1644, phụ nữ Mãn Châu thường sử dụng tên thật, nhưng sau năm 1644, những cái tên này "biến mất khỏi các hồ sơ lưu trữ và phả hệ."[190] Chỉ sau khi những cô gái hoàng tộc này đến tuổi trưởng thành và kết hôn thì họ mới được trao phong hiệu và về sau thường được biết đến với phong hiệu này.[190] Mặc dù 5/6 Hoàng nữ của Thuận Trị hoàng đế chết khi còn nhỏ, nhưng tất cả họ đều xuất hiện trong phả hệ gia đình Ái Tân Giác La.[190]

Con gái nuôi